Der gebürtige Südtiroler Christof Messner schloss seine Ausbildung am Konservatorium der Stadt Wien mit Auszeichnung ab. Seitdem spielt er zahlreiche Hauptrollen an diversen deutschsprachigen Theatern, so am Stadttheater Klagenfurt (Freddy in My Fair Lady), an der Oper Graz (Grimm in Grimm!, Rodney Hatch in Ein Hauch von Venus), am Staatstheater am Gärtnerplatz München (Hendrik Egerman in Das Lächeln einer Sommernacht), Stadttheater Bozen (Perchik in Anatevka, Tony in West Side Story) sowie bei den Bad Hersfelder Festspielen (Claude in Hair). Als festes Ensemblemitglied am Landestheater Linz verkörperte er Ben in Lazarus, Adam Hochberg in Ein Amerikaner in Paris, Harry Houdini in Ragtime und Edmund de Waal in der preisgekrönten Uraufführung Der Hase mit den Bernsteinaugen. Weitere Engagements führten ihn an die Oper Graz als Sky Masterson in Guys and Dolls sowie an das Staatstheater Saarbrücken als Leopold im Weißen Rössl. Darüber hinaus verkörperte er Albert Kestner bei der Uraufführung von Goethe! bei den Bad Hersfelder Festspielen.
Messner gewann 2009 den 1. Platz beim ersten österreichischen Wettbewerb für musikalisches Unterhaltungstheater MUT. 2015 wurde er von der Deutschen Musicalakademie als bester Darsteller in einer Hauptrolle für Grimm! ausgezeichnet. Er ist zudem Preisträger der Lotte Lenya Competition 2018 in New York und war 2021 für Goethe! in der Kategorie „Bester Darsteller in einer Hauptrolle“ beim Deutschen Musical Theater Preis nominiert.
2023 war er als Dr. Madden in Next to Normal am Theater Bern und als Harry in Mamma Mia! bei den Seefestspielen Mörbisch zu sehen. Als Filmemacher und Hauptcharakter Mark Cohen debütierte er im Musical Rent an der Oper Dortmund. Der Sommer 2024 führte ihn als Antagonist Anastasius in Die Päpstin in der Neuinszenierung von Gil Mehmert zum Sommermusical Fulda. An der Musikalischen Komödie in Leipzig gab er den Rolf in Thomas Hermanns‘ Uraufführung Hello! Again? sowie Tony in West Side Story an der Volksoper Wien. Im Sommer 2025 spielte er Moritz Spiegelberg in Die Räuber bei den Bad Hersfelder Festspielen. Derzeit ist er an der Staatsoper Hannover als Billy Crocker in Anything Goes zu sehen.
In der Grazer Neuproduktion Arizona Lady verkörpert er in der Spielzeit 2025/26 den Roy Dexter.