Nikolaus Webern, geboren in der Steiermark, studierte Bühnengestaltung an der Akademie der bildenden Künste in Wien in der Meisterklasse für Szenografie. Er arbeitet seither an Theatern in ganz Europa – u. a. am Theater an der Wien (Kammeroper), an der Staatsoper Hamburg Opera Stabile, am Staatstheater Karlsruhe (Falstaff, L´elisir d´amore, Die lustigen Nibelungen), am Theater Regensburg (La Boheme, Madama Butterfly, Martha), an der Volksoper Wien (Pinocchio), bei den Bregenzer Festspielen (Le nozze di Figaro, Eugen Onegin, Armida), der Neuen Oper Wien (Orest, Die Staatsoperette, Angels in America, Stallerhof), am Theater Chemnitz (Die Fledermaus, Die Entführung aus dem Serail), am Theater St. Gallen (Pollicino, Fidelio), an der Oper Dortmund (Aida), am Staatstheater Cottbus (Die lustige Witwe), am Theater Freiburg (Das schlaue Füchslein, Rusalka, Hänsel und Gretel) beim Verdi Festival in Parma (Falstaff), an der Komischen Oper Berlin (Der Zauberer von Oz), dem Opernhaus Zürich (Il barbiere di Siviglia) und am Teatro San Carlo in Neapel (Ermione).
2008 wurde Nikolaus Webern für sein Raumkonzept zu Hamlet für den Offenbacher Löwen der Hessischen Theaterakademie nominiert. 2011 gewann er für das Bühnenbild zu Gefangen in der Realität, einer Bearbeitung der Fledermaus, den ring.award off in Graz. 2020 wurde er für den Österreichischen Musiktheaterpreis in der Kategorie Beste Ausstattung für Eugen Onegin bei den Bregenzer Festspielen nominiert.